Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms