Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dbx1P52950 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dbx1P52950 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms