Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CcnfP51944 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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