Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TspoP50637 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TspoP50637 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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