Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt6aP50446 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt6aP50446 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt6aP50446 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt6aP50446 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt6aP50446 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt6aP50446 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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