Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc13P50207 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc13P50207 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms