Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms