Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LmnaP48678 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LmnaP48678 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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