Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms