Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd4P46935 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms