Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl28P41105 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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