Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpardP35396 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpardP35396 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PpardP35396 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms