Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rom1P32958 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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