Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc5P32043 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc5P32043 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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