Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VtnP29788 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VtnP29788 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VtnP29788 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms