Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprmP28828 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms