Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Celf1P28659 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Celf1P28659 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms