Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChgaP26339 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms