Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RhoP15409 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms