Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms