Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nr4a1P12813 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms