Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prf1P10820 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prf1P10820 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prf1P10820 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prf1P10820 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms