Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms