Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf1P09925 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf1P09925 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf1P09925 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms