Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcn4O70507 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcn4O70507 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms