Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SfnO70456 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SfnO70456 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SfnO70456 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SfnO70456 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms