Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlkO54988 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlkO54988 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlkO54988 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlkO54988 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlkO54988 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms