Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lsm2O35900 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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