Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21310J3QQ23 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21310J3QQ23 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Gm21310J3QQ23 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21310J3QQ23 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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