Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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