Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp408H7BX78 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms