Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crocc2F6XLV1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms