Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms