Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip11E9Q512 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms