Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde8bE9Q4S1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde8bE9Q4S1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms