Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp558E9Q1J0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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