Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt78E9Q0F0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms