Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3095E9Q058 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms