Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sfta2E9PXB6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms