Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3002E9PW72 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms