Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc144bE9PVZ3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms