Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc175E9PVB3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms