Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6A3

Ism2, Isthmin 2, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism2D3Z6A3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ism2D3Z6A3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ism2D3Z6A3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms