Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nlrc5C3VPR6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms