Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smok3bC0HKC9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smok3bC0HKC9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smok3bC0HKC9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smok3bC0HKC9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smok3bC0HKC9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smok3bC0HKC9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms