Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2B9EJA2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms