Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Phf11bB4XVQ1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Phf11bB4XVQ1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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