Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Phf11cB4XVP9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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