Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cspp1B2RX88 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms