Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap58B2RW38 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap58B2RW38 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms